Родился 31 октября 1950 года в селе Сурель (в настоящее время – село Кетросу), района Дрокия, Республики Молдова.

В 1966 году с успехом сдал вступительные экзамены в Педагогическую Школу города Сороки и был зачислен на специальность Музыкальный работник.

В 1970 году поступает в Институт Искусств им. «Гавриила Музическу» (в настоящее время – Академия Музыки, Театра и Изобразительных Искусств). Во время учебы играет в Оркестре народной музыки «Мэрцишор», после чего начинает работать в Оркестре народной музыки «Веселия».

На протяжении многих лет Арсений Ботнару плодотворно сотрудничал с Оркестром народной музыки Радиотелевидения Молдовы «Фолклор», с которым записал 3 альбома (компании «Мелодия» и «Электрекорд»): «Satule, grădină dulce» (в дуэте с Марией Сарабаш), «Гляжу с тоской на село», «Таков танец в Молдове», и еще один альбом был записан с оркестром «Веселия».

К настоящему времени выпущено 8 аудиокассет и 6 CD дисков, записано 2 музыкальных фильма: «Я оставил тебя, родное село», «La Nistru, la mărgioară» и 4 творческих вечера.

Арсений Ботнару побывал с концертами во многих странах, таких как Никарагуа, Вьетнам, Канада, Финляндия, Германия, Болгария, Польша, Австрия, Франция, Румыния и др.

Начиная с 1995 года, и по настоящее время А. Ботнару работает в ансамбле песен и плясок «Плай Молдовенеск».
Является лауреатом республиканских и международных конкурсов, а также Всемирных фестивалей – в Москве (1985), в Монреале и Квебеке (1990). Был награжден «Орденом Дружбы» Республики Вьетнам.

В 1995 году согласно указу Президента Республики Молдова ему было присвоено почетное звание «Заслуженный деятель искусства», а также он был награжден орденом «Трудовой славы» в 2000 году. Согласно приказу № 397 Министерства внутренних дел, был награжден крестом II класса «За заслуги» в 2005 году.